Главное отличие самцов от самок - расстояние между дырками (анальным отверстием и мочеиспускательным каналом). У самцов оно большое, а у самок маленькое. Смотри фотографии:
http://s002.radikal.ru/i199/1109/ab/5d70f83f9f58.jpg
http://s60.radikal.ru/i167/1109/6b/83859697eea8.jpg
Если перевернуть хомяка вверх ногами и слегка надавить на брюшную полость, то у самца семенники (яички) станут хорошо заметными. У самки этого не произойдёт. Смотри фотографии:
http://s13.radikal.ru/i186/1109/6f/e3b1517ca9a0.jpg
http://i063.radikal.ru/1109/a4/0bb266767266.jpg
Примечание: на фотографиях изображены хомяки продажного возраста (1 месяц)